2019年，学院设有船舶与海洋工程、信息工程、水声工程3个特色鲜明的本科专业。

船舶与海洋工程

面向国家海洋战略需求，依托兵器科学与技术和船舶与海洋工程学科开展本科人才培养，通识教育和个性化培养紧密结合，开设3个课程群，培养从事海洋结构物、水下航行器和动力系统设计、制造、试验、减震降噪等方面的行业领军人才。

信息工程

依托“水下信息与控制”国家重点实验室，以电类专业人才培养方案为基础，开设2个课程群。培养水声信息处理、通信与组网、信息对抗以及从事信息工程领域科学研究、工程设计、技术开发等方面的行业领军人才。

水声工程

围绕国家海洋安全和智慧海洋重大战略需求，依托水声工程国家重点学科，开设2个课程群，面向水下物理场、水下声信息处理、声纳系统设计、水声定位于跟踪识别、海洋信息智能感知、海洋大数据处理、噪声控制等领域培养行业领军人才。